Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPINA1P01009 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPINA1P01009 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPINA1P01009 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPINA1P01009 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPINA1P01009 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPINA1P01009 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SERPINA1P01009 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SERPINA1P01009 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SERPINA1P01009 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SERPINA1P01009 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SERPINA1P01009 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SERPINA1P01009 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SERPINA1P01009 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SERPINA1P01009 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SERPINA1P01009 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERPINA1P01009 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms