Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX58O95786 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX58O95786 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX58O95786 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX58O95786 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX58O95786 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX58O95786 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX58O95786 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX58O95786 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX58O95786 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX58O95786 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX58O95786 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX58O95786 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX58O95786 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX58O95786 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DDX58O95786 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DDX58O95786 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX58O95786 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX58O95786 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX58O95786 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX58O95786 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX58O95786 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX58O95786 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX58O95786 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX58O95786 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX58O95786 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX58O95786 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX58O95786 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX58O95786 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX58O95786 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX58O95786 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX58O95786 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX58O95786 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX58O95786 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX58O95786 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX58O95786 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX58O95786 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX58O95786 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX58O95786 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX58O95786 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX58O95786 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX58O95786 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX58O95786 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX58O95786 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX58O95786 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX58O95786 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX58O95786 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX58O95786 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX58O95786 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX58O95786 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX58O95786 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX58O95786 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX58O95786 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX58O95786 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX58O95786 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX58O95786 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX58O95786 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX58O95786 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX58O95786 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX58O95786 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX58O95786 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX58O95786 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX58O95786 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX58O95786 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX58O95786 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX58O95786 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX58O95786 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX58O95786 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX58O95786 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX58O95786 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX58O95786 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX58O95786 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX58O95786 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX58O95786 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX58O95786 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX58O95786 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX58O95786 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX58O95786 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX58O95786 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX58O95786 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX58O95786 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX58O95786 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX58O95786 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX58O95786 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX58O95786 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX58O95786 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX58O95786 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX58O95786 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX58O95786 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX58O95786 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX58O95786 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX58O95786 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX58O95786 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX58O95786 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX58O95786 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX58O95786 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX58O95786 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX58O95786 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX58O95786 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX58O95786 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms