Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC27.58■■■□□ 2
POLR1AO95602 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
POLR1AO95602 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms