Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms