Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL18O94889 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL18O94889 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms