Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F6O75461 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F6O75461 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F6O75461 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F6O75461 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F6O75461 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F6O75461 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F6O75461 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F6O75461 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F6O75461 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F6O75461 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F6O75461 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F6O75461 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F6O75461 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F6O75461 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F6O75461 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F6O75461 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F6O75461 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F6O75461 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F6O75461 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F6O75461 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F6O75461 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F6O75461 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F6O75461 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F6O75461 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F6O75461 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F6O75461 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F6O75461 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F6O75461 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F6O75461 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F6O75461 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F6O75461 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F6O75461 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F6O75461 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F6O75461 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F6O75461 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F6O75461 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F6O75461 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F6O75461 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F6O75461 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F6O75461 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F6O75461 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F6O75461 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F6O75461 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F6O75461 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F6O75461 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F6O75461 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F6O75461 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F6O75461 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F6O75461 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F6O75461 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F6O75461 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F6O75461 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F6O75461 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
E2F6O75461 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F6O75461 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F6O75461 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F6O75461 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F6O75461 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F6O75461 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F6O75461 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F6O75461 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F6O75461 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F6O75461 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F6O75461 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F6O75461 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F6O75461 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F6O75461 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F6O75461 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F6O75461 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F6O75461 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F6O75461 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F6O75461 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F6O75461 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F6O75461 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F6O75461 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F6O75461 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F6O75461 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F6O75461 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F6O75461 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F6O75461 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F6O75461 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F6O75461 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F6O75461 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F6O75461 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F6O75461 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F6O75461 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F6O75461 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F6O75461 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F6O75461 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F6O75461 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F6O75461 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F6O75461 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F6O75461 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F6O75461 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F6O75461 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F6O75461 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F6O75461 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F6O75461 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F6O75461 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms