Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAMP4O75379 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms