Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms