Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA3EO15041 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3EO15041 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms