Protein–RNA interactions for Protein: O00267

SUPT5H, Transcription elongation factor SPT5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT5HO00267 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SUPT5HO00267 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SUPT5HO00267 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms