Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
J3QR89 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
J3QR89 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
J3QR89 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
J3QR89 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
J3QR89 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
J3QR89 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
J3QR89 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3QR89 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3QR89 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3QR89 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3QR89 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3QR89 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3QR89 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3QR89 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3QR89 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3QR89 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3QR89 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3QR89 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3QR89 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3QR89 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3QR89 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3QR89 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3QR89 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3QR89 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
J3QR89 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3QR89 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3QR89 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3QR89 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3QR89 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3QR89 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3QR89 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3QR89 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3QR89 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3QR89 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3QR89 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3QR89 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3QR89 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3QR89 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3QR89 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3QR89 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
J3QR89 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3QR89 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3QR89 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3QR89 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3QR89 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3QR89 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3QR89 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3QR89 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3QR89 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3QR89 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3QR89 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3QR89 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3QR89 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3QR89 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3QR89 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3QR89 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3QR89 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3QR89 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3QR89 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3QR89 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3QR89 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3QR89 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3QR89 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3QR89 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3QR89 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3QR89 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3QR89 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3QR89 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3QR89 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
J3QR89 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3QR89 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3QR89 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3QR89 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3QR89 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3QR89 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3QR89 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3QR89 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3QR89 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3QR89 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3QR89 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3QR89 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3QR89 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3QR89 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
J3QR89 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3QR89 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3QR89 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3QR89 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3QR89 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3QR89 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3QR89 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3QR89 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3QR89 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3QR89 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
J3QR89 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3QR89 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3QR89 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3QR89 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3QR89 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
J3QR89 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms