Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms