Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NEDD8-MDP1E9PL57 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms