Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRCP1A6NGW2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRCP1A6NGW2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRCP1A6NGW2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRCP1A6NGW2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRCP1A6NGW2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRCP1A6NGW2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRCP1A6NGW2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRCP1A6NGW2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRCP1A6NGW2 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRCP1A6NGW2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRCP1A6NGW2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRCP1A6NGW2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCP1A6NGW2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCP1A6NGW2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCP1A6NGW2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCP1A6NGW2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCP1A6NGW2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCP1A6NGW2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCP1A6NGW2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCP1A6NGW2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCP1A6NGW2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCP1A6NGW2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCP1A6NGW2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCP1A6NGW2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCP1A6NGW2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCP1A6NGW2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCP1A6NGW2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCP1A6NGW2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCP1A6NGW2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCP1A6NGW2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCP1A6NGW2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCP1A6NGW2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCP1A6NGW2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRCP1A6NGW2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
STRCP1A6NGW2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
STRCP1A6NGW2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
STRCP1A6NGW2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRCP1A6NGW2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms