Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms