Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C5orf49A4QMS7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms