Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB19A4D1S5 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms