Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMB4A4D0S4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMB4A4D0S4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms