Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF22A3QJZ6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms