Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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