Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 ATG13-201ENST00000359513 4348 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF185-204ENST00000370268 4305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 IKZF5-205ENST00000617859 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 BAZ2A-214ENST00000551812 8600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA2D4-221ENST00000586184 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF626-203ENST00000601440 5963 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 MXRA5-201ENST00000217939 9793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 COL12A1-207ENST00000483888 9637 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ODF2-209ENST00000434106 3890 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 METTL2B-204ENST00000480046 5743 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 POGK-201ENST00000367875 6254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP4R1-203ENST00000400556 3925 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 AL590004.4-201ENST00000566733 7060 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 NSD2-224ENST00000514045 3964 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 FLJ36000-201ENST00000612344 3801 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 SPEN-201ENST00000375759 12232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 AL133230.1-201ENST00000431019 4587 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 PROM1-210ENST00000510224 4006 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 KALRN-202ENST00000291478 10888 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ETV1-210ENST00000430479 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 TATDN2-203ENST00000448281 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 EGF-206ENST00000509793 4489 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 RASA2-201ENST00000286364 5614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 MICAL2-202ENST00000342902 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 SYNJ1-206ENST00000433931 4852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 PTK2B-210ENST00000517339 3914 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 GIT2-203ENST00000355312 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 AMPD3-209ENST00000529507 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ESRRG-221ENST00000493603 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 NBR1-206ENST00000590996 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 BSN-201ENST00000296452 15955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 SPATA19-201ENST00000299140 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP173-201ENST00000362821 315 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP336-201ENST00000364189 117 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 AL121781.1-201ENST00000419863 168 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 AC152007.1-201ENST00000428521 224 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 AL354983.1-201ENST00000434580 906 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 AC006463.1-201ENST00000445929 232 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092634.4-203ENST00000451395 448 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL395P-201ENST00000462960 291 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL259P-201ENST00000478499 253 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 SNRPCP8-201ENST00000514820 211 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 HAL-203ENST00000541929 3846 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 BCAP31P2-201ENST00000563143 399 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 BCAP31P1-201ENST00000565437 385 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009060.2-201ENST00000569264 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4450-201ENST00000583589 65 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 AC138904.2-201ENST00000614412 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR3191-201ENST00000636300 76 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRM-203ENST00000400060 5030 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 XPNPEP2-202ENST00000371106 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP7B-204ENST00000400370 3252 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 NPIPB11-201ENST00000524087 3653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 FNDC3A-204ENST00000492622 6286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 SACS-202ENST00000402364 15134 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMYND8-201ENST00000262975 4139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 SORBS1-204ENST00000361941 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 TULP4-201ENST00000367094 5170 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 RBM19-203ENST00000545145 4422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 APOL2-202ENST00000358502 2551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 BBS9-203ENST00000355070 4004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 FIGNL1-206ENST00000433017 3626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms