Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
LAPTM4AQ15012 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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