Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR3160-2-201ENST00000637870 81 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 PKD1L2-202ENST00000337114 3427 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC26A9-203ENST00000367135 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF587-202ENST00000419854 5731 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 PAQR5-202ENST00000395407 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 DISP2-201ENST00000267889 12614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 CADM1-203ENST00000452722 8588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 NCKAP1L-201ENST00000293373 9016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF45-201ENST00000269973 3898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 CAND1-208ENST00000545606 11251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF3-201ENST00000296315 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 CORO2B-203ENST00000543950 3611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 MTMR3-205ENST00000406629 3758 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D14-207ENST00000448507 4887 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 GREB1L-209ENST00000580732 8749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCA9-202ENST00000453985 6116 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 CRX-201ENST00000221996 4470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC24A1-201ENST00000261892 5768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 GPATCH8-208ENST00000591680 4692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 PEG3-201ENST00000326441 8723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 MYH10-202ENST00000360416 7762 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 CU638689.4-201ENST00000623047 5990 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 CTCFL-207ENST00000429804 3864 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 TFCP2L1-201ENST00000263707 9292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 CSMD1-218ENST00000635120 11737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ENAH-204ENST00000366844 13168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP1-201ENST00000311956 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 CR1-206ENST00000400960 6959 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 CMKLR1-202ENST00000412676 5110 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 CLUHP3-206ENST00000562354 4117 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 MPRIP-205ENST00000395811 10960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 LARS2-203ENST00000415258 4744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 FAT4-201ENST00000335110 9669 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 PHTF2-205ENST00000416283 5198 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 GTF3C2-201ENST00000264720 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA2D4-222ENST00000587995 3883 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 AL353770.3-201ENST00000616253 1988 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO5C-201ENST00000261839 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 NAIP-208ENST00000517649 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 C2CD3-201ENST00000313663 6283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 AMOT-201ENST00000304758 6888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 RSU1-205ENST00000602389 3639 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 BAG6-234ENST00000211379 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 CORO1C-202ENST00000420959 3921 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00689-203ENST00000438049 3946 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC23A2-201ENST00000338244 6944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 PIEZO2-203ENST00000503781 8259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 KRTAP6-2-201ENST00000334897 313 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP7D3-204ENST00000370663 4446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR185-201ENST00000385288 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 AL022721.1-201ENST00000436521 505 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005077.3-202ENST00000437494 300 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 AC246785.1-201ENST00000440916 264 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL62P-201ENST00000498506 297 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 AC034105.2-201ENST00000561866 238 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL531P-201ENST00000578464 282 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL557P-201ENST00000581047 286 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR3689C-201ENST00000581239 72 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL82P-201ENST00000611435 237 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6083-201ENST00000612737 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL628P-201ENST00000619139 237 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 TMPRSS4-AS1-204ENST00000636151 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 AC138951.1-201ENST00000502532 2685 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms