Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
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AP3B2Q13367 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
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AP3B2Q13367 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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AP3B2Q13367 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
AP3B2Q13367 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
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