Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms