Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
C4orf17Q53FE4 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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