Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 HIVEP2-202ENST00000367603 9724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 DOCK8-204ENST00000432829 7452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 SCN8A-203ENST00000545061 11433 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 ERBB4-202ENST00000342788 12136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 SPRYD4-201ENST00000338146 10779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KRTAP21-2Q3LI59 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms