Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ODF1Q14990 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.6 ms