Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 SLC7A14-201ENST00000231706 10103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
CHIC1Q5VXU3 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CHIC1Q5VXU3 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CHIC1Q5VXU3 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CHIC1Q5VXU3 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CHIC1Q5VXU3 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CHIC1Q5VXU3 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CHIC1Q5VXU3 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CHIC1Q5VXU3 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CHIC1Q5VXU3 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CHIC1Q5VXU3 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CHIC1Q5VXU3 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CHIC1Q5VXU3 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CHIC1Q5VXU3 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CHIC1Q5VXU3 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CHIC1Q5VXU3 UNC79-202ENST00000393151 7908 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CHIC1Q5VXU3 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CHIC1Q5VXU3 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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