Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCAQ16586 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.9 ms