Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U3KQ87 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U3KQ87 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U3KQ87 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U3KQ87 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U3KQ87 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQ87 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQ87 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQ87 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQ87 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQ87 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQ87 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQ87 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQ87 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQ87 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQ87 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQ87 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQ87 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQ87 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQ87 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQ87 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQ87 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQ87 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQ87 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQ87 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQ87 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQ87 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQ87 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQ87 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQ87 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQ87 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQ87 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQ87 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQ87 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQ87 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQ87 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQ87 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQ87 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQ87 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQ87 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQ87 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQ87 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQ87 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQ87 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQ87 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQ87 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQ87 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQ87 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQ87 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQ87 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQ87 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQ87 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQ87 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQ87 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQ87 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQ87 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQ87 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQ87 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQ87 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQ87 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQ87 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQ87 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQ87 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQ87 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQ87 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQ87 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQ87 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQ87 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQ87 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQ87 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQ87 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQ87 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQ87 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQ87 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQ87 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQ87 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQ87 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQ87 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQ87 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQ87 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQ87 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQ87 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQ87 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQ87 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQ87 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQ87 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQ87 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQ87 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQ87 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQ87 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQ87 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQ87 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQ87 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQ87 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQ87 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
U3KQ87 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
U3KQ87 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
U3KQ87 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
U3KQ87 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
U3KQ87 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms