Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms