Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X1

SERP1, Stress-associated endoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERP1Q9Y6X1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SERP1Q9Y6X1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms