Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B9

SUPT16H, FACT complex subunit SPT16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT16HQ9Y5B9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUPT16HQ9Y5B9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms