Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NRXN3Q9Y4C0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRXN3Q9Y4C0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms