Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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HCN4Q9Y3Q4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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HCN4Q9Y3Q4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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HCN4Q9Y3Q4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
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HCN4Q9Y3Q4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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HCN4Q9Y3Q4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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HCN4Q9Y3Q4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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HCN4Q9Y3Q4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
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HCN4Q9Y3Q4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HCN4Q9Y3Q4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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