Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FARSAQ9Y285 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms