Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNQ9UQP3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms