Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAK1Q9UPV9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms