Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX6Q9UNH7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX6Q9UNH7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX6Q9UNH7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX6Q9UNH7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX6Q9UNH7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX6Q9UNH7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX6Q9UNH7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX6Q9UNH7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX6Q9UNH7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX6Q9UNH7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX6Q9UNH7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms