Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRXN1Q9ULB1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms