Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms