Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC9Q9UKV0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms