Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SALL4Q9UJQ4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms