Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA9Q9UGM1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms