Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VTI1BQ9UEU0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VTI1BQ9UEU0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms