Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPG2Q9UBF2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms