Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms