Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWF4

SLC52A1, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 1, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A1Q9NWF4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC52A1Q9NWF4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC52A1Q9NWF4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC52A1Q9NWF4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC52A1Q9NWF4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC52A1Q9NWF4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC52A1Q9NWF4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC52A1Q9NWF4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC52A1Q9NWF4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC52A1Q9NWF4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC52A1Q9NWF4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC52A1Q9NWF4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC52A1Q9NWF4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC52A1Q9NWF4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC52A1Q9NWF4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC52A1Q9NWF4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC52A1Q9NWF4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC52A1Q9NWF4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC52A1Q9NWF4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC52A1Q9NWF4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC52A1Q9NWF4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC52A1Q9NWF4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC52A1Q9NWF4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SLC52A1Q9NWF4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC52A1Q9NWF4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms