Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms